Τα όργανα Διοίκησης του Επιμελητηρίου είναι δύο,
- το Διοικητικό Συμβούλιο και
- η Διοικούσα Επιτροπή.

Τα 61 μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου εκλέγονται από τα ταμειακώς εντάξει μέλη του Επιμελητηρίου με εκλογές που διεξάγονται κάθε τέταρτο έτος, σύμφωνα με τον Ν.3419/05 σε ημερομηνία που ορίζεται μεταξύ της 15ης Νοεμβρίου και 15ης Δεκεμβρίου.

Οι εκλογές διεξάγονται με ενιαίο κατά συνδυασμό ψηφοδέλτιο με το σύστημα της απλής αναλογικής και δικαίωμα ψήφου έχουν οι κατωτέρω, εφόσον είναι ταμειακώς εντάξει και έχει παρέλθει ένα έτος από την εγγραφή τους στο Επιμελητήριο, το οποίο ασκείται ως εξής:

Κάθε    φυσικό πρόσωπο μία ψήφο.
Κάθε    Ο.Ε. - Ε.Ε. μέχρι δύο ψήφους    των Ομόρρυθμων μελών
   της που υποδεικνύονται από τον νόμιμο εκπρόσωπο αυτών.
Κάθε    Ε.Π.Ε. μέχρι δύο ψήφους    των διαχειριστών ή ενός
   διαχειριστή ή ενός εταίρου της.
Κάθε    Ανώνυμη Εταιρεία μέχρι τρείς ψήφους    των εκπροσώπων
   της που υποδεικνύονται από το Δ.Σ. και μπορεί να είναι μέλη
   αυτού ή ανώτατα διευθυντικά στελέχη της, που ορίζονται με ειδική
   απόφαση του Δ.Σ.
Κάθε    υποκατάστημα μία ψήφο    του διευθυντή του ή του
   αναπληρωτή αυτού.
Κάθε    αλλοδαπή Α.Ε. και Ε.Π.Ε. μία ψήφο    του νόμιμου
   εκπροσώπου της ή του πράκτορα ή του αντικλήτου της, υπό τον
   όρο της αμοιβαιότητας.
Κάθε    συνεταιρισμός δύο ψήφους    του προέδρου και του
   γενικού γραμματέα ή των αναπληρωτών τους.

Το 61-μελές Διοικητικό Συμβούλιο το οποίο εκλέγεται με αυτη την διαδικασία, εκλέγει την πενταμελή Διοικητική Επιτροπή.